Bošnjački institut posjeduje bogatu i vrijednu zbirku orijentalno-islamskih rukopisa koji su nastajali širom islamskog svijeta od 14. do početka 20. stoljeća.

U cilju očuvanja ovog jedinstvenog, autentičnog i raritetnog pisanog naslijeđa, Institut sistematski radi na njegovom prikupljanju i očuvanju više od trideset godina. Poput drugih zbirki, i ova je nastajala postepeno, od prvih godina prikupljanja bibliotečke i arhivske građe trudom i zalaganjem osnivača i vakifa Instituta Adil-bega Zulfikarpašića i njegove supruge Tatjane, pa sve do danas kada Institut ulaže značajne napore i sredstva za njihovo kontinuirano prikupljanje, zaštitu, prezentaciju i dostupnost. Tokom godina, veliki broj rukopisa je poklonjen Bošnjačkom institutu, na čemu se iskreno zahvaljujemo svim vakifima na njihovim poklonima. Ujedno nas veseli činjenica da su svi donatori pojedinačnih rukopisa ili čitavih dijelova rukopisnih biblioteka duboko svjesni značaja institucionalnih zbirki, jer jedino institucionalna stručnost, zaštita, briga i njega će osigurati da ovo nacionalno blago ostati sačuvano i dostupno javnosti i budućim generacijama.

Kompletna zbirka od 1086 kodeksa u kojima su identifikovana 1662 djela su publicirana u tri toma kataloga čime je kompletan rukopisni fond učinjen dostupnim domaćoj i svjetskoj naučnoj stručnoj i kulturnoj javnosti. U 2019. godini izašao je iz štampe i predstavljen je javnosti III tom Kataloga, u kojem je dr. Mustafa Jahić obradio 343 kodeksa sa identificirih 537 djela.

U posljednjem periodu uradilo se puno i na unapređenju dostupnosti i očuvanju fonda. Nešto više od dvije trećine rukopisa je digitalizirano (743 kodeksa sa 1125 djela) i u digitalnoj formi dostupno na zahtjev. Također, cjelokupan fond je konzerviran na način da su primijenjeni osnovni konzervatorsko-restauratorski metodi očuvanja i zaštite.

Time je skoro u potpunosti okončan sveobuhvatni tretman rukopisnog fonda, od stručne obrade, adekvatnog smještaja, izdavanja kataloga, digitalizacije i konzervacije. Zbirka će se i dalje širiti poklonima i otkupima, sa nadom se neće čekati predugo na izdavanje IV toma kataloga.

Sva tri toma kataloga orijentalno-islamskih rukopisa Bošnjačkog instituta su dostupni kod izdavača, u Bošnjačkom institutu, a rukopisi odnosno digitalne kopije na zahtjev.